黄珠子草，一年生草本，通常直立，高达60厘米；
茎基部具窄棱，或有时主茎不明显；
枝条通常自茎基部发出，上部扁平而具棱；
全株无毛。
叶片近革质，线状披针形、长圆形或狭椭圆形，长5-25毫米，宽2-7毫米，顶端钝或急尖，有小尖头，基部圆而稍偏斜；
几无叶柄；
托叶膜质，卵状三角形，长约1毫米，褐红色。
通常2-4朵雄花和1朵雌花同簇生于叶腋；
雄花：直径约1毫米；
花梗长约2毫米；
萼片6，宽卵形或近圆形，长约0.5毫米；
雄花3，花丝分离，花药近球形；
花粉粒圆球形，直径为23微米，具多合沟孔；
花盘腺体6，长圆形；
雌花：花梗长约5毫米；
花萼深6裂，裂片卵状长圆形，长约1毫米，紫红色，外折，边缘稍膜质；
花盘圆盘状，不分裂；
子房圆球形，3室，具鳞片状凸起，花柱分离，2深裂几达基部，反卷。
蒴果扁球形，直径2-3毫米，紫红色，有鳞片状凸起；
果梗丝状，长5-12毫米；
萼片宿存；
种子小，长0.5 毫米，具细疣点。
花期4-5月，果期6-11月。
