心叶肋柱花，一年生草本，高13-21厘米。
茎直立，常紫红色，四棱形，从基部或中部以上分枝，枝斜升，细瘦。
基生叶在花期枯落；
茎生叶无柄，卵状心形，长8-10毫米，基部宽6-8毫米，先端钝，基部心形，半抱茎，叶脉弧形，5-7条，在下面明显。
聚伞花序或单花生分枝顶端；
花梗细瘦，长1.5-5厘米，近四棱形，花5数；
花萼长为花冠的1/2，裂片宽椭圆形或椭圆形，长5-8毫米，宽2.5-5毫米，先端钝，基部狭缩，叶脉3条，不明显；
花冠蓝紫色或淡蓝紫色，裂片卵状椭圆形，长10-14毫米，宽5-6毫米，先端急尖，基部两侧各具1个腺窝，腺窝管形，上部边缘具裂片状流苏；
花丝线形，长5-6毫米，花药矩圆形，蓝色，长约2毫米；
子房长6-7毫米，柱头下延于子房上部。
花期8-10月。