蓝堇草,直根细长,粗径2-3.5毫米,生少数侧根。
茎(2-)4-9(-17)条,多少斜升,生少数分枝,高8-30厘米。
基生叶多数,无毛;
叶片轮廓三角状卵形,长0.8-2.7厘米,宽1-3厘米,三全裂,中全裂片等边菱形,长达12毫米,宽达11毫米,下延成的细柄,常再三深裂,深裂片长椭圆状倒卵形至线状狭倒卵形,常具1-4个钝锯齿,侧全裂片通常无柄,不等二深裂;
叶柄长2.5-13厘米。
茎生叶1-2,小。
花小,直径3-5毫米;
花梗纤细,长3-30毫米;
萼片椭圆形,淡黄色,长3-4.5毫米,宽1.7-2毫米,具3条脉,顶端钝或急尖;
花瓣长约1毫米,近二唇形,上唇顶端圆,下唇较短;
雄蕊通常10-15,花药淡黄色,长0.5毫米左右,花丝长约2.5毫米;
心皮6-20,长约2毫米,无毛。
蓇葖直立,线状长椭圆形,长8-10毫米;
种子4-14粒,卵球形或狭卵球形,长0.5-0.7毫米。
5-6月开花,6-7月结果。