小叶茯蕨，植株高17-32厘米。
根状茎短而直立，连同叶柄基部疏被红棕色的阔披针形鳞片和密被灰白色针状毛。
叶簇生；
叶柄长10-17厘米，纤细，柔弱，深禾秆色，通体疏被单细胞针状长毛；
叶片戟状披针形，长14-20厘米，基部戟形，宽4-6厘米，中部宽2.5-4厘米，向顶端渐变狭，渐尖头，一回羽状；
羽片16-20对，近对生，平展，近无柄，下部2-3对分离，向上的多少与叶轴合生，彼此接近，基部一对最大，长2-3厘米，宽1厘米，平展，长圆披针形，钝头或短急尖头，基部平截，对称，羽裂达1/2；
裂片4-6对，卵圆形，全缘；
自第二对起，羽片突然缩短，长1.5-2厘米，与基部一对同形，相距1-1.5厘米，中部各对羽片同大，同形，基部与叶轴合生，但彼此分离，上部各对比中部的略短，基部有阔翅相连，全缘或下部的略呈浅圆齿状。
叶脉明显，小脉在裂片上3-4对，单一，斜向上，基部一对出自主脉基部以上甚远处，其上侧一条伸达缺刻内或稍上处的叶边，下侧一条伸达远离缺刻以上的叶边。
叶薄草质，干后褐棕色，羽片上面布满针状毛，下面沿羽轴连同叶轴有开展的灰白色针状细毛，沿叶脉疏被柔毛。
孢子囊群线形，通常沿基部一对小脉的下半部着生；
孢子囊体近顶处有3-4根刚毛。
