念珠凤仙花，一年生草本，高20-60厘米，全株近无毛，具少数支柱根。
茎柔软，细或下部粗，直立或铺散分枝；
分枝稍弯曲。
叶互生，具柄；
叶片薄膜质，卵形，长圆形或稍圆形，或最上部叶卵状披针形，长4-8.5厘米，顶端钝尾尖，基部宽楔形或近圆形，边缘具粗圆齿，齿端微凹，具小尖，齿间无刚毛，最上部的叶近无柄，有时长圆形，基部圆形或心形，叶柄纤细，长1-4厘米，侧脉4-6对，极细。
总花梗生于叶腋，丝状，长1-3厘米，被疏微毛，或脱毛，具1-3花；
花梗长10-15毫米，结果时明显伸长，最下部的花梗中部具苞片；
苞片线状刚毛形，长约2毫米，宿存。
花小，粉红色，长1.5厘米，侧生萼片2，卵形，基部心形，长3-4毫米，顶端尖或渐尖，全缘或一侧边缘具齿，中肋背面具钝鸡冠状突起；
旗瓣圆形，螺壳状，直径6-8毫米，背面中肋中部具狭鸡冠状突起；
翼瓣无柄，长12-14毫米，2裂，基部裂片小，有时几乎不发育，上部裂片反折，具柄，半月形，上部骤然变狭，顶端钝，背部具明显小耳齿状或圆形；
唇瓣檐部舟状，平展，弧状弯，长5-6毫米，距位于檐部中部，与檐部近等长，顶端全缘或2浅裂。
花丝细；
花药小，顶端钝。
子房纺锤形，直立，渐尖。
蒴果线形，长2.5-3.5厘米，念珠状，顶端尖。
种子多数，椭圆状，长3.5-4毫米，栗褐色，有光泽。
花期8月。