黄花岩黄芪的茎多数，直立，无毛或被微柔毛，具明显棱槽。
黄花岩黄芪生长在海拔约3200-4200米的山地针叶林的林下及其针叶林带的砾石质山坡、灌丛环境中。
黄花岩黄芪的根为直根系，明显木质化。
黄花岩黄芪的种子淡黄褐色，半圆状肾形，长约2毫米，宽约1.5毫米。