南湖斑叶兰，植株高约9厘米。
根状茎伸长，茎状，匍匐，具节。
茎直立，绿色，或多或少被疏柔毛，基部具4-5枚叶，向上在叶和总状花序基部花之间具2-3枚鳞片，鳞片披针形，长1-1.5厘米，先端渐尖，无毛。
叶直立伸展，叶片小，卵形，长约2厘米，中部以下宽1.3厘米，两面无毛，背面淡绿色，上面绿色，沿中肋具1条白色的带，先端稍钝，基部圆形，具柄，叶柄长1厘米，基部扩大成鞘。
总状花序直立，长约4厘米，具10-15朵稍密生，近偏向一侧的花；
花苞片卵状披针形，长约1厘米，膜质，先端渐尖，下部的较子房稍长，上部的逐渐变短；
子房圆柱状纺锤形，被细毛，连花梗长7-8毫米；
花白色略带红晕，半张开；
萼片近等大，凹陷，具1脉，背面无毛，中萼片披针形，长6毫米，宽2．2毫米，向先端收狭，先端急尖，与花瓣粘合呈兜状；
侧萼片斜卵状披针形，长7毫米，基部宽3毫米，先端急尖；
花瓣与中萼片等长，中部稍增宽，宽2.2毫米，先端钝头，基部收狭，无毛，具1脉；
唇瓣长5-6毫米，基部宽2.6毫米，卵状舟形，前部舟状，先端急尖，常向下弯，基部凹陷呈囊状，囊高3-3.5毫米，内面无毛；
蕊柱短，粗，长约1.5毫米；
花药卵状心形，先端急尖；
花粉团长1.3毫米；
蕊喙短，长不及1毫米，2裂。
花期7-8月。
