短梗烟堇，一年生草本，高10-40厘米，无毛。
主根圆柱形，长5-6厘米或更长，粗1-2毫米，具侧根和纤细状细根。
茎自基部分枝，具纵棱。
基生叶数枚，叶片多回羽状分裂，小裂片线形、线状长圆形或狭披针形，长0.5-1.5厘米，叶柄长3-4厘米，基部具短鞘；
茎生叶多数，叶片同基生叶，叶柄较短。
总状花序顶生和对叶生，长1.5-2厘米，多花，密集排列；
花序梗短粗或近无；
苞片钻形，长1.5-2.5毫米；
花梗长1.5-2.5毫米。
萼片小，长0.5-1毫米，具撕裂状齿，早落；
花瓣粉红色或淡紫红色，上花瓣长5-6毫米，花瓣片膜质，先端暗紫色，背部具鸡冠状突起，距短粗，长约1毫米，粗约1.2毫米，略上升，下花瓣舟状狭长圆形，长4-5毫米，先端圆，暗紫色，中部较狭，膜质，内花瓣近匙形，长3.5-4.5毫米，膜质，先端圆，具尖头，上部深紫色；
雄蕊束长3.5-4.5毫米，花丝下部合生，花药极小；
子房卵形，长约1毫米，花柱丝状，长2-3毫米，柱头具2乳突。
果序长2-3厘米；
坚果圆球形，直径1.5-2毫米，果皮具小瘤状皱纹；
果梗长2-3毫米，与苞片近等长或稍长。
花果期5-8月。
