福建柏，乔木，高达17米；
树皮紫褐色，平滑；
生鳞叶的小枝扁平，排成一平面，二、三年生枝褐色，光滑，圆柱形。
鳞叶2对交叉对生，成节状，生于幼树或萌芽枝上的中央之叶呈楔状倒披针形，通常长4-7毫米，宽1-1.2毫米，上面之叶蓝绿色，下面之叶中脉隆起，两侧具凹陷的白色气孔带，侧面之叶对折，近长椭圆形，多少斜展，较中央之叶为长，通常长5-10毫米，宽2-3毫米，背有棱脊，先端渐尖或微急尖，通常直而斜展，稀微向内曲，背侧面具1凹陷的白色气孔带；
生于成龄树上之叶较小，两侧之叶长2-7毫米，先端稍内曲，急尖或微钝，常较中央的叶稍长或近于等长。
雄球花近球形，长约4毫米。
球果近球形，熟时褐色，径2-2.5厘米；
种鳞顶部多角形，表面皱缩稍凹陷，中间有一小尖头突起; 种子顶端尖，具3-4棱，长约4毫米，上部有两个大小不等的翅，大翅近卵形，长约5毫米，小翅窄小，长约1.5毫米。
花期3-4月，种子翌年10-11月成熟。
