紫茎飞蓬，多年生草本，根状茎近木质或块状，径3-5毫米，具短分枝，颈部被褐色的残存的叶基部。
茎数个或单生，高5-7厘米，基部径约1毫米，全部紫色，直立或斜升，中部或较下部有分枝，少有不分枝，被疏短毛和短贴毛，杂有具柄腺毛。
基部叶密集，莲座状，花期生存，匙形或倒披针形，长1.5-2.5厘米，宽0.3-0.6厘米，全缘，或有2-3个钝齿，顶端钝或稍尖，基部渐狭成具窄翅的柄，有三出脉，茎叶3-5个，线状披针形或线形，0.5-2厘米，宽0.1-0.3厘米，全缘，无柄，具1或不明显的三出脉，边缘具上弯的硬短毛，两面被短贴毛和具柄的腺毛。
头状花序2-3个排列成伞房状，稀单生，径0.8-1.5厘米，总苞半球形，长5-8毫米，宽5-12毫米，总苞片3层，紫色，线状披针形或线形，宽0.5毫米，顶端渐尖，不超出花盘或内层与花盘等长，背面被开展的疏长毛和贴短毛，基部常杂有具柄腺毛，外层长2-3毫米，内层长8毫米，具狭膜质的边缘，具1脉，近无毛。
外围的雌花舌状，2-3层，长6-7毫米，管部长约3毫米，上部被微毛，舌片近丝状，紫色，宽约0.3毫米，不开展，干时内卷成管状，顶端具2小齿；
中央的两性花管状，黄色，长4-4.5毫米，檐部狭漏斗形，被疏微毛，裂片紫色，无毛；
花药伸出花冠。
瘦果长圆形，长约2毫米，宽0.5毫米，扁压，被疏短毛；
冠毛淡黄色，2层，外层极短，内层长约5毫米。
花期8-9月。