甘肃黄芪的叶子是羽状复叶基生，有15-33片小叶，长4-11厘米。
甘肃黄芪的荚果狭椭圆状长圆形，先端尖，长13-14毫米，宽4-6毫米，稍膨胀，果颈与萼筒近等长。
甘肃黄芪的花萼管状，长7-9毫米，密被黑色柔毛，萼齿披针形或钻形，长2-3毫米。
甘肃黄芪的龙骨瓣较旗瓣短或近等长，瓣片半卵形，具短耳，瓣柄与瓣片近等长。