甘肃黄芪的龙骨瓣较旗瓣短或近等长，瓣片半卵形，具短耳，瓣柄与瓣片近等长。
甘肃黄芪的小叶卵形，长5-9毫米，宽2-4毫米，先端钝圆，基部圆形或微心形，近无柄。
甘肃黄芪的根直伸，暗褐色，颈部具数个细瘦的根状茎。
甘肃黄芪的花冠是青紫色。