羽轴丝瓣芹，矮小草本，高15-25厘米。
根块状，径约5毫米。
茎单生，细弱，基部不分枝，上部有少数分枝，无毛。
基生叶的叶柄纤细，长约5厘米，叶鞘短，边缘膜质；
叶片轮廓呈阔三角形，1-2回羽状分裂，一回羽片有羽轴，末回裂片近倒卵形至长椭圆状披针形，长5-8毫米，宽2-3毫米，全缘或顶端3浅裂；
序托叶的叶柄呈鞘状，叶片羽状分裂，羽片2-3对，或3深裂以至不分裂，裂片长3-8毫米，宽约1毫米。
顶生伞形花序梗短，无总苞片和小总苞片；
伞辐4-5，丝状，长1.5-2.7厘米；
小伞形花序有花6-9，花柄长不超过1厘米；
无萼齿；
花瓣淡紫色，披针形至卵状披针形，长2-3毫米，宽约0.5毫米，基部略窄，顶端丝状，长约占花瓣1/2；
花丝长约1毫米，花药近圆形；
花柱基圆盘状，花柱在幼果时向外反折，略长于花柱基。
幼果卵圆形，主棱丝状，无毛。
花期8-9月，果期9-10月。
