独龙乌头，块根倒圆锥形，长约4厘米，粗约1厘米。
茎高85-110厘米，被反曲或稍伸展的短柔毛，中部以下常变无毛，等距地生叶，不分枝。
茎下部叶具长柄，在开花时枯萎，茎中部叶具稍长柄；
叶片形状与亚东乌头相似，五角形，长5.5-7.5厘米，宽约9厘米，三深裂至距基部6-10毫米处，中央深裂片通常宽菱形，间或菱形。
总状花序多少狭长，长15-37厘米，宽5-10厘米，有8-35朵花；
轴被反曲或混生伸展的淡黄色短柔毛；
苞片叶状；
花梗长2.5-7厘米，密被伸展的淡黄色短柔毛；
小苞片生花梗下部至上部，通常线形，长2.5-4毫米，有时最下面花梗的小苞片稍大，三裂；
萼片紫色，外面疏被短柔毛，上萼片盔形，具短爪，高约2厘米，自基部至喙长1.5-1.8厘米；
花瓣无毛或几无毛，唇长约4.5毫米，距长约2毫米，向后弯曲；
雄蕊无毛，花丝全缘或有2枚小齿；
心皮5或4，子房多少密被淡黄色短柔毛。
蓇葖长1-1.8厘米；
种子倒卵形，具三棱52，生横翅。
8-9月开花。