巴东乌头，块根狭倒圆锥形，长约1.6厘米。
茎高14-30厘米，稍之字形弯曲，有开展的柔毛，等距地生3-5叶，上部近伞房状分枝或不分枝。
基生叶1-2，和茎下部叶有长柄；
叶片肾状五角形，长2-2.8厘米，宽4-5.4厘米，三深裂至距基部3-6毫米处，各回裂片互相接近，中央深裂片菱状倒卵形，三浅裂，上部边缘有钝齿，侧深裂片斜扇形，不等二裂稍超过中部；
叶柄长5-10厘米。
花单生分枝顶端；
小苞片椭圆形，长约7毫米；
上萼片船形或船状盔形，自基部至喙长2-2.3厘米，喙尖，近平展，侧萼片圆倒卵形，长约1.6厘米，下萼片宽或狭椭圆形；
心皮3，子房有白色柔毛。