大花玄参的蒴果狭尖卵形，连同短喙长约7毫米。
大花玄参的花萼长5-7毫米，歪斜，多少二唇形，上方3裂片开裂较浅，下方2裂片开裂较深而小，顶端锐尖，无毛或有疏腺毛。
大花玄参的花冠黄色，长9-15毫米，外面无毛，上唇及其下筒中有长柔毛，上唇显著长于下唇。
大花玄参的茎常丛生，中空，有疏毛，基部各节具苞片状鳞叶。