大花玄参的花冠黄色，长9-15毫米，外面无毛，上唇及其下筒中有长柔毛，上唇显著长于下唇。
大花玄参的退化雄蕊圆形或多少肾形。
大花玄参的花序近头状或多少伸长为穗状，长3-10厘米，有腺毛，具1-3轮，聚伞花序具花1-3朵。
大花玄参的花期是5-7月，果期是8月。