滇边大黄，矮小草本，高15-28厘米，根常具横环纹，黑褐色，内部淡黄色。
茎直立，通常实心无空腔，基部直径3-5毫米，常暗紫，被稀疏短毛。
基生叶2-4片，叶片近革质，矩圆状椭圆形或卵状椭圆形，稀近圆形或长椭圆形，长3-6厘米，宽2.5-5厘米，顶端钝圆，基部近心形或近圆形，全缘到不明显浅波状，基出脉3-5条，主脉发达粗壮，侧脉2-4对，叶上面暗绿色，一般光滑无毛或在主脉上具短硬毛，下面浅绿色，脉常紫色，被短硬毛，毛多生于叶脉及边缘；
叶柄细，半圆柱状，与叶片等长或稍长，此外紫色，被淡棕色短毛；
茎生叶1-2片，上部叶腋常具花序枝，叶片较小，最上面者呈条形；
托叶鞘短，不抱茎，干后膜质，常被损，无毛。
圆锥花序，窄长，只一次分枝，常紫色，被短硬毛；
花3-4簇生，花较大而花被开展，直径约5毫米；
花梗细长，长3-4.5毫米，关节位于下部，花被片长椭圆形，外轮3片较小，长1.5-2毫米，宽约1毫米，内轮3片较大，长约2.5毫米，宽1.5毫米或稍强，边缘深红紫色，仅外面中央部分绿色；
雄蕊9,稀较少，花丝短，长1-1.5毫米，基部扁阔，与花盘粘连，紫色，花药宽椭圆到近球状，亦紫色；
花盘薄，略呈瓣状；
子房倒卵形，绿色，花柱反曲，柱头扁头状，紫色。
果实心状圆形或稍扁圆形，直径8-9毫米，顶端圆阔，中间具#$#V#$#字形小凹，基部心形，翅宽约2.5毫米，纵脉在翅的中部以内，靠近种子。
种子卵形。
花期6-7月，果期8-9月。
