白色、粉红色
花序从茎的基部发出，常1-2个，斜立，长4-8.5厘米，不分枝，花序轴疏生2-5朵花；花序柄暗紫色，粗约2毫米，被1-2枚膜质鞘；花苞片膜质，卵状三角形，长4-5毫米，先端锐尖。
华西蝴蝶兰的中裂片肉质，深紫色，摊平后呈宽倒卵形或倒卵状椭圆形，长8-13毫米，上部宽6-9毫米，先端钝并且稍2裂，基部具1枚紫色而先端深裂为2叉状的附属物，边缘白色、下弯而形成倒舟状，上面中央具1条纵向脊突，脊突在近唇瓣先端处强烈增厚而隆起。
华西蝴蝶兰的唇瓣基部具长2-3毫米的爪，3裂；侧裂片上半部紫色，下半部黄色，直立，狭长，长约6毫米，中部缢缩，上部扩大而先端斜截，在基部具1个中央对开的肉脊，中间具穴并且向外隆起呈**状，内面中央的凸缘黄色，其先端斜截并且具2至数个小缺刻。