巴东木莲，乔木，高达25米，胸径1.4米；
树皮淡灰褐色带红色；
小枝带灰褐色。
叶薄革质，倒卵状椭圆形，长14-18 (20) 厘米，宽3.5-7厘米，先端尾状渐尖，基部楔形。
两面无毛，上面绿色，有光泽，下面淡绿色；
侧脉每边13-15条，叶面中脉凹下；
叶柄长2.5-3厘米；
叶柄上的托叶痕长为叶柄长的五分之一至7分之一；
花白色，有芳香，径8.5-11厘米；
花梗长约1.5厘米，花被片下5-10毫米处具1苞片脱落痕，花被片9，外轮3片近革质，狭长圆形，先端圆，长4.5-6厘米，宽1.5-2.5厘米，中轮及内轮肉质，倒卵形，长4.5-5.5厘米，宽2-3.5厘米，雄蕊长6-8毫米，花药紫红色，长5-6毫米，药室基部靠合，有时上端稍分开，药隔伸出成钝尖头，长约1毫米；
雌蕊群圆锥形，长约2厘米，雌蕊背面无纵沟纹，每心皮有胚珠4一8。
聚合果圆柱状椭圆形，长5-9厘米，径2.5-3厘米，淡紫红色。
蓇葖露出面具点状凸起。
花期5-6月，果期7-10月。
