小石松，多年生沼地或湿地生植物。
主茎匍匐状，长5-20厘米，单一或多回二叉分枝，直径1-2毫米，枝连叶宽5-8毫米。
叶螺旋状排列，但偏向地面一侧，匍匐面叶片少，密生，斜升，披针形至线形，黄绿色，弯曲，长4-7毫米，宽0.5-1.1毫米，基部不变狭，下延，无柄，先端渐尖，边缘全缘，两面光滑，无光泽，中脉不明显，纸质。
孢子枝单生，直立，高3-8厘米，枝连苞片宽4-10毫米；
苞片密生，线形或线状披针形；
孢子囊穗单生，圆柱形，长1-5厘米，直径5-7毫米，黄绿色；
孢子叶两种形状，线状披针形和披针形，覆瓦状排列，长2-5毫米，宽0.5-1.2毫米，先端渐尖或钝，全缘，纸质，黄绿色；
孢子囊生于孢子叶腋，内藏或略露出，近球形，直径约0.5毫米，顶端渐尖，黄色。