金丝桃的花序具1-15(-30)花，自茎端第1节生出，疏松的近伞房状，有时亦自茎端1-3节生出，稀有1-2对次生分枝；花梗长0.8-2.8 (-5 )厘米。
金丝桃的别名有狗胡花（安徽霍山）、金线蝴蝶（四川南川，浙江乐清）、过路黄（四川奉节）、金丝海棠（山东唠山）、金丝莲（陕西石泉）。
金丝桃的花直径3-6.5厘米，星状；花瓣金黄色至柠檬黄色，无红晕，开张，三角状倒卵形，长2-3.4厘米，宽1-2厘米。
金丝桃的叶片形状有倒披针形、椭圆形、长圆形、披针形、卵状三角形或卵形。