水蛇麻，一年生草本，高30-80厘米，枝直立，纤细，少分枝或不分枝，幼时绿色后变黑色，微被长柔毛。
叶膜质，卵圆形至宽卵圆形，长5-10厘米，宽3-5厘米，先端急尖，基部心形至楔形，边缘锯齿三角形，微钝，两面被粗糙贴伏柔毛，侧脉每边3-4条；
叶片在基部稍下延成叶柄；
叶柄被柔毛。
花单性，聚伞花序腋生，直径约5毫米；
雄花钟形；
花被裂片长约1毫米，雄蕊伸出花被片外，与花被片对生；
雌花，花被片宽舟状，稍长于雄花被片，子房近扁球形，花柱侧生，丝状，长1-1.5毫米，约长于子房2倍。
瘦果略扁，具三棱，表面散生细小瘤体；
种子1颗。
花期5-8月。
