短苞金黄柴胡的花期为8月，果期为9月。
花期为7-8月，果期为8-9月。
短苞金黄柴胡的小总苞片特别小，狭卵形或线状披针形，长2-3毫米，宽0.7-2毫米，顶端尖或钝尖，基部变狭，3脉，短于开花时的小伞形花序。
顶生花序直径可达10厘米，侧生花序直径3-5厘米，总苞片3-5，不等大，卵形、三角形至近圆形，伞辐6-10，不等长。