甘肃黄芪的模式标本采自甘肃马衔山。
甘肃黄芪的龙骨瓣较旗瓣短或近等长，瓣片半卵形，具短耳，瓣柄与瓣片近等长。
甘肃黄芪的叶子是羽状复叶基生，有15-33片小叶，长4-11厘米。
甘肃黄芪的旗瓣倒卵形，长14-15毫米，先端微凹，基部渐狭成瓣柄。