毛果缬草，矮小草本，高 (5-) 10 (-18) 厘米，根状茎短而不明显，簇生许多带状须根。
匍枝细长，节部具近膜质的鳞片，枝端簇生须带状不定根和匍枝叶，后者圆形、全缘、长宽各4毫米，柄长1.5厘米。
茎直立单生，在干标本上略呈红色，除节部具粗毛外，其余光秃或疏被粗毛。
基生叶在干标本（花、果期）上未见。
茎生叶2 (-3) 对，倒卵形，长1.5-3厘米，宽1-1.5厘米，羽状分裂，裂度中等，不达中肋而形成宽约1.5-2毫米的叶轴；
裂片3-9，长圆形至倒卵形，全缘；
顶裂片长1-1.5厘米，宽0.6-0.8厘米，与最前的一对侧裂片挤生在一起；
侧裂片与顶裂片同形，互相疏离，愈向叶柄基部愈小；
叶柄宽，近膜质，最下一对叶柄的长度常为叶长的2倍，渐向上渐短而至无柄，边缘有粗毛。
聚伞花序头状，长宽各约1厘米，顶生。
小苞片匙形至披针形，近膜质。
花冠红色，筒状，全长约5毫米，花冠裂片椭圆状长圆形，长约2毫米，筒部内侧具长柔毛。
雌雄蕊均伸出于花冠之外。
果序较花序稍疏展，长约3-4厘米，宽2-3厘米。
瘦果椭圆状卵形，长约3.5-4毫米，最宽处约2毫米，两面均密被粗长毛，冠毛粗长，为果长的1倍以上。
小苞片稍短于成熟的果实。
花期7-8月，果期8-9月。
