柄花茜草的花序腋生和顶生，聚伞花序排成圆锥花序式，主轴和分枝均有直棱，被短糙毛或近无毛，通常比叶长；小苞片披针形或近卵形，长3-5毫米，渐尖或短尖，多少被糙毛，很少近无毛。
4-6月
柄花茜草与R. manjith Roxb. ex Flem.的区别在于前者花冠5裂至中部，冠管杯状。
柄花茜草的果实为浆果，球形，单生或孪生，直径约4-5毫米，成熟时黑色。