阴郁马先蒿的根系是须状成圆丛，生于根颈之上，根颈下接鞭状根茎，深入地下的粗根茎未见。
阴郁马先蒿的叶子线形至线状披针形。
阴郁马先蒿的萼片狭钟形，常被密毛，有时几光滑，齿多变，有时几相等，有时后方一枚较小。
阴郁马先蒿的花冠是黄色。