顶果膜蕨，植株高8-10厘米。
根状茎纤细，丝状，横走，粗约0.3毫米，暗褐色，与叶柄不易区别，疏被柔毛或几光滑。
叶远生，相距1-2厘米；
叶柄长2-2.5厘米，无翅，疏被柔毛；
叶片狭长披针形，长7-10厘米，宽12-15毫米，二回深羽裂；
羽片斜长圆形，10-12对，长8-10毫米，宽5-6毫米，基部几对近生，其余的密接，互生，无柄，斜向上，基部斜楔形，深羽裂几达羽轴；
裂片3-4对，线形，长2.5-3毫米，宽约1毫米，钝头，边缘有尖锯齿，基部上侧的裂片较长而常分叉。
叶脉叉状分枝，两面明显隆起，暗褐色，与叶轴及羽轴上面同被褐色贴生的柔毛；
末回裂片有小脉1条，不达到裂片先端。
叶为薄膜质，半透明，干后为暗褐色。
叶轴暗褐色，除基部外均有狭翅，叶轴及羽轴均稍曲折。
孢子囊羣只生于叶片的先端，位于羽片的上部裂片的顶部，生孢子囊羣的裂片在囊苞之下显著缩狭；
囊苞狭长卵形，长1.5-2毫米，宽约1毫米，两唇瓣分裂到基部以上，先端尖锐并有尖齿。