台湾天麻，植株矮小，高3-6厘米，但在果期由于果梗的不断延长，高可达25-50厘米；
根状茎多少块茎状，近纺锤形，长3-4厘米，直径5-12毫米，黄褐色，节上具鳞片状鞘。
茎肉质，下部浅褐色，上部深色，具较密的节。
总状花序较缩短，具2-10朵花；
花苞片暗色，短于花梗；
花梗和子房长1.1-1.6厘米；
花密集，直径9-12毫米，近直立或平展，浅绿褐色或变为暗褐色；
萼片和花瓣合生的花被筒长8-11毫米，近钟形，外面具小疣状突起，前方（侧萼片合生处）裂口较深，达全长的4/5，两侧的裂口较浅，仅达全长的3/5；
内轮裂片（花瓣离生部分）近卵形，贴生于筒的裂口处；
唇瓣近卵形，长约7毫米，宽约5毫米，基部有短爪，爪上有2个胼胝体；
蕊柱近棒状，长4-5毫米，上部有翅，腹面有1个先端2裂的附属物；
附属物几与蕊柱等长；
柱头近顶生；
蕊喙不存在。
蒴果圆筒状，长3-4厘米，果梗在果期明显延长并直立，高举直立的蒴果。
花期9-10月。