晶帽石斛的花期是5-7月，果期是7-8月。
晶帽石斛的蒴果长圆柱形，长6厘米，粗1.7厘米。
晶帽石斛的茎直立或斜立，稍肉质，圆柱形，长60-70厘米，粗5-7毫米，不分枝，具多节，节间长3-4厘米。
晶帽石斛的总状花序数个，出自去年生落了叶的老茎上部，具1-2朵花；花序柄短，长6-8毫米，基部被3-4枚长3-5毫米的鞘。