云南杓兰，植株高20-37厘米，具粗短的根状茎。
茎直立，无毛或在上部近节处疏被短柔毛，基部具数枚鞘，鞘上方具3-4枚叶。
叶片椭圆形或椭圆状披针形，长6-14厘米，宽1-3.5厘米，先端渐尖，上面无毛或疏被微柔毛，背面被微柔毛，毛尤以脉上为多。
花序顶生，具1花；
花序柄上端疏被短柔毛；
花苞片叶状，卵状椭圆形或卵状披针形，长4-6厘米，宽1.5厘米，先端急尖或渐尖，两面疏被短柔毛；
花梗和子房长2-3.5厘米，无毛或上部稍被毛；
花略小，粉红色、淡紫红色或偶见灰白色，有深色的脉纹，退化雄蕊白色并在中央具1条紫条纹；
中萼片卵状椭圆形，长2.2-3.2厘米，宽1.2-1.6厘米，先端渐尖；
合萼片椭圆状披针形，与中萼片等长，宽8-10毫米，先端2浅裂；
花瓣披针形，长2.2-3.2厘米，宽7-8毫米，先端渐尖，稍扭转或不扭转，内表面基部具毛；
唇瓣深囊状，椭圆形，长2.2-3.2厘米，宽1.5-1.8厘米，囊口周围有浅色的圈，囊底有毛，外面无毛；
退化雄蕊椭圆形或卵形，长6-7毫米，宽3-4毫米，基部近无柄。
花期5月。
