蒙古莸的子房长圆形，无毛，柱头2裂。蒴果椭圆状球形，无毛，果瓣具翅。
蓝紫色
蒙古莸的聚伞花序腋生，无苞片和小苞片。花萼钟状，外面密生灰白色绒毛，深5裂。花冠蓝紫色，长约1厘米，外面被短毛，5裂，下唇中裂片较长大，边缘流苏状。雄蕊4枚，几等长。蒴果椭圆状球形，无毛，果瓣具翅。
蒙古莸是落叶小灌木，通常自基部即分枝，高度为0.3到1.5米。嫩枝紫褐色，圆柱形，有毛，老枝毛渐脱落。叶片厚纸质，线状披针形或线状长圆形，全缘，很少有稀齿，表面深绿色，稍被细毛，背面密生灰白色绒毛。