高山紫菀的瘦果长圆形，基部较狭，长3毫米，宽1-1.2毫米，褐色，被密绢毛。
高山紫菀的总苞片2-3层，等长或外层稍短。
高山紫菀的下部叶在花期生存，匙状或线状长圆形，长1-10厘米，宽0.4-1.5厘米，渐狭成具翅的柄，有时成长达11厘米的细柄，全缘，顶端圆形或稍尖。
高山紫菀的头状花序在茎端单生，径3-3.5或达5厘米。