高山紫菀的瘦果长圆形,基部较狭,长3毫米,宽1-1.2毫米,褐色,被密绢毛。
高山紫菀的下部叶在花期生存,匙状或线状长圆形,长1-10厘米,宽0.4-1.5厘米,渐狭成具翅的柄,有时成长达11厘米的细柄,全缘,顶端圆形或稍尖。
原变种var. alpinus茎高10-20厘米,有时达30厘米,头状花序径3-3.5厘米。
蛇岩变种 var. serpentimontanus 的茎高10-20厘米,有时达35厘米。头状花序径3.5-5.5厘米。