甘青小蒿，一年生草本。
主根单一，纤细，侧根少；
茎细，单生，直立或斜向上，高20-30厘米有细纵棱，自茎下部开始分枝，枝长5-15厘米；
茎、枝下部微有短柔毛，上部密生绵毛。
叶初时有蛛丝状绵毛，后稀疏或渐无毛；
基生叶小，密集着生，羽状全裂，裂片边缘通常具1-2枚浅裂齿，裂齿先端钝或叶不分裂；
茎下部与中部叶长圆形或椭圆形，长2-3厘米，宽1-1.5厘米，羽状全裂，每侧有裂片2（-3）枚，裂片狭线形，长0.5-0.8厘米，宽1-2毫米，先端钝尖或锐尖，基部裂片半抱茎，无叶柄；
上部叶与苞片叶5或3全裂或不分裂，裂片或不分裂之苞片叶狭线形。
头状花序宽卵形或半球形，直径2.5-3毫米，具短梗或近无梗，有小苞叶，在分枝上排成穗状花序式的总状花序或复总状花序，而在茎上排成疏松、略开展的圆锥花序；
总苞片3-4层，外层总苞片略狭小，外、中层总苞片披针形或卵形，背面暗褐色或绿褐色，初时密被绵毛，后稀疏，边狭膜质，内层总苞片倒卵形，半膜质，顶端有撕裂齿；
雌花8-12朵，花冠狭管状或略呈狭圆锥状，檐部具2裂齿，花柱稍伸出花冠外，先端2叉；
两性花10-18朵，花冠管状，花药线形，先端附属物尖，长三角形，基部圆钝，花柱与花冠近等长，先端2叉，叉端截形，有睫毛。
瘦果小，卵形或近倒卵形。
花果期8-10月。