蜀藏兜蕊兰，植株高5-12厘米。
块茎圆球形，肉质，直径5-8毫米。
茎纤细，直立或近直立，无毛，基部具2枚筒状鞘，近基部具1枚叶。
叶片长圆形，长2-2.5厘米，宽8-10毫米，先端钝，基部收狭并抱茎。
总状花序具3-8朵花，长2-2.5厘米；
花苞片线形，呈螺旋状卷曲，先端渐尖，较子房短；
子房纺锤形，扭转，无毛，连花梗长3-7毫米；
花小，绿色；
中萼片直立，宽卵形，长1.5-1.75毫米，宽1.3-1.75毫米，先端圆钝，中间具1小凸尖，凹陷，具1脉，与花瓣靠合呈兜状；
侧萼片反折，长圆形，长2-2.75毫米，宽1-1.2毫米，先端钝，具1脉；
花瓣直立，斜长圆形，凹陷呈舟状，长1.3-2毫米，宽0.5-0.7毫米，先端钝或稍尖且兜状，具1脉；
唇瓣反折，线状舌形，肉质，长1.8-2.1毫米，先端钝，基部扩大，宽约0.8毫米；
蕊柱短，宽约0.5毫米；
花药直立，药隔极宽，兜状，先端钝；
蕊喙大，三角形，位于药室之间；
柱头2个，隆起，具柄。
花期9月。