黄芩的根茎为清凉性解热消炎药，可治疗上呼吸道感染，急性胃肠炎等，少量服用有苦补健胃的作用。黄芩制剂和黄芩酊可治疗植物性神经的动脉硬化性高血压以及神经系统的机能障碍，外用有抗生作用。
黄芩主要有两种黄芩碱素的衍生物，分别是汉黄芩素（Woogonin，C16H12O5）和黄芩甙（baicalin, C21H18O11）。
黄芩分布在黑龙江，辽宁，内蒙古，河北，河南，甘肃，陕西，山西，山东，四川等地；江苏有栽培。此外，苏联东西伯利亚，蒙古，朝鲜，日本均有分布。
黄芩的花期是7-8月，果期是8-9月。