黑花茜草的根多条簇生，条状，明显肉质，紫红色。
黑花茜草产于四川木里及云南中甸、大理、大姚、楚雄、景东、文山、广南。
黑花茜草的果实（未成熟）为小球形，直径约3毫米，干时黑色，单生或双生。
黑花茜草的学名是Rubia mandersii Coll. et Hemsl.