新疆五针松主要生长在新疆阿尔泰山西北部的布尔津河上游的卡纳斯河和霍姆河流域，海拔1600-2350米，气候冷湿，山地生草灰化土地带。
新疆五针松的木材优良，材质轻软，结构细，有香气，耐久用，可作建筑、家具等用材。
新疆五针松的树皮是淡褐色或灰褐色，枝条较密，颜色为黄色或淡褐黄色，密被淡黄色长柔毛。
新疆五针松的种子为黄褐色，倒卵圆形，长约1厘米，直径5-6毫米，微具棱脊，无翅。