糠秕马先蒿的花冠紫红色，管长6毫米，无毛，喉部扩大，脉纹显著扭转，使其冠之上部多少返顾，盔的直立部分约与管等长，端以直角转折而成合有雄蕊的部分，前方再渐狭为喙，喙长约5毫米，端二裂，其裂片自身再作浅二裂，外方一枚小裂卵形，较大很多，较突然地凸出。
糠秕马先蒿的花期为6-7月，果期为7-8月。
糠秕马先蒿的叶片长25-60毫米，宽15-40毫米，长圆状卵形至卵形，上面有疏毛或几无毛，有时被有白色糠粃状物，下面网较清晰，被疏毛，更有密生白色糠粃状物，羽状深裂，裂片4-6对，卵形至披针形，裂得最深者可达中肋2/3处，缘有不规则之锯齿。
糠秕马先蒿属于玄参科（Scrophulariaceae）。