珠芽蟹甲草是一种多年生草本植物，茎单生，具束生的须根，直立，植物高约85厘米，茎坚硬，具纵细槽棱，基部裸露，常变紫色，上部被蛛丝状毛。
珠芽蟹甲草的头状花序多数，在茎端排列成总状或复总状花序，花序长达40厘米，花冠黄色，长10毫米，管部长4毫米，裂片线形，花药伸出花冠，基部具尾。
珠芽蟹甲草与日本产的Cacalia farfarifolia Sieb. et Zucc.较为近似。
珠芽蟹甲草的叶柄长3-5厘米，无翅，上部的叶柄渐短。