大理青兰的花期是8-9月。
花萼长1.4-1.6厘米，外面密被短柔毛及睫毛，2裂约至1/3处，上唇3裂至本身4/5处，3齿完全等大，长三角形，先端钻状渐尖，下唇略短，2裂稍超过本身基部，齿似上唇之齿。
大理青兰的花冠是蓝色的。
叶无柄或几无柄，轮廓卵圆形，长9-26毫米，宽10-20毫米，基部宽楔形，羽状全裂，全裂片3-4对，对生或近对生，相距2-6毫米，与中脉成钝角或45°斜展，线形，先端钝，长6.5-17毫米，宽0.8-1.6毫米。