丽江翠雀花，茎高10-25（-50）厘米，被反曲的短柔毛，中部有时变无毛，不分枝。
叶5-7生于茎基部或近基部处，有长柄；
叶片五角状圆形，直径4.5-6厘米，三全裂达基部或至距基部1-1.5毫米处，中央全裂片菱形，近羽状二回深裂，侧全裂片斜扇形，不等2深裂，两面无毛或近无毛；
叶柄长6-13厘米，无毛，基部有狭鞘。
总状花序有1-4花；
基部苞片叶状，上部苞片不分裂，长圆形或长圆状线形；
花梗直展，长2.6-10厘米，密被反曲的短伏毛；
小苞片距花1.5-6毫米或与花邻接，狭卵形或长圆状卵形，长0.9-2厘米；
萼片蓝色，长2-2.5厘米，外面被短伏毛，上萼片船状宽椭圆形，其他萼片宽卵形或宽椭圆形，距圆锥状筒形，长1.1-1.8厘米，基部粗3.5-5毫米；
花瓣蓝色，无毛，顶端钝；
退化雄蕊蓝色，瓣片二浅裂，有时分裂达中部，腹面有黄色髯毛；
雄蕊无毛；
心皮3，子房密被短柔毛。
蓇葖长1.2-1.4厘米；
种子灰褐色，近球形，长2-2.5毫米，沿稜有纵翅。
8-9月开花。
