箭药叉柱兰，植株高9-13厘米。
根状茎匍匐，橄榄绿色，肉质，具4-6节，节间长5-15毫米，节的中部粗6-10毫米，呈莲藕状。
茎短，直立，具2-3枚叶。
叶片卵形，长12-16毫米，宽8-10毫米，暗绿色，具较深色的脉，中肋在两面明显，先端急尖或渐尖，基部近心形，具柄；
叶柄带紫绿色，长和宽各3-4毫米，鞘状抱茎。
花茎细长，长7-9厘米，粗2毫米，被毛，上具3-7枚鞘状苞片；
总状花序具2-8朵花；
花苞片粉红色，舟状，长7毫米；
子房圆柱形，长5-6毫米，粗1.5-2毫米，无毛；
花小；
萼片长5毫米，橄榄绿染粉红色，下部2/3处合生成筒状，外侧无毛，萼筒长3毫米，基部稍呈浅囊状，上部分离，分离部分长2毫米；
花瓣白色，偏斜，倒披针形，与中萼片紧贴，长5毫米，宽1.5毫米；
唇瓣长达11.5毫米，与蕊柱的基部贴生，基部肉质，边缘内弯，囊状，囊内两侧各具1枚白色、2裂、裂片为角状的胼胝体，中部具短爪，前部扩大，轮廓近圆形，直径7毫米，2裂，裂片基部无斑点，裂片之间的中部绿色，其余部分为白色，裂片边缘各具5-8条、长2毫米的丝状裂条；
蕊柱短，长1毫米，扁圆柱形，背部膜质，下部肉质，顶部两侧具向前延伸成1条狭、渐尖的、长1.5毫米的臂状附属物；
花药黄色，箭形，长1毫米；
花粉团共同具1枚长1毫米、线状披针形的粘盘；
蕊喙向前突出，叉状2裂，其裂片长1.5毫米，粘盘位于蕊喙的2裂片之间；
柱头2个，侧生，位于蕊喙的基部两侧。
花期3-5月。
