滇南石豆兰，假鳞茎卵形，卧伏在根状茎上，彼此无明显的间隙，仅上部稍抬起，长15-30毫米，粗10-15毫米，被膜质鞘，顶生1枚叶。
叶片椭圆形或长圆形，长3-15厘米，宽1.7-3.7厘米，先端钝并且稍凹入，基部具长5-10毫米的柄。
花葶从假鳞茎基部发出，具1-2朵花；
花序柄长7-25毫米，基部被鞘；
花苞片宽卵形，长7-10毫米，先端锐尖；
花梗和子房纤细，圆柱形，长2-3厘米；
花黄色带紫色斑点；
中萼片椭圆形，长12毫米，中部宽6毫米，先端锐尖，具7条脉；
侧萼片卵状三角形，长17毫米，基部上方宽8毫米，先端锐尖，具7条脉；
花瓣倒卵状椭圆形，长9毫米，中部宽5毫米，先端钝，具4条脉；
唇瓣舌形，肉质，基部两侧边缘稍具齿，中部以上稍向外下弯，基部与蕊柱足连接而形成活动关节，先端钝，上面密被疣状突起，中央具2条波状褶片；
蕊柱粗短，长约3毫米；
蕊柱足长7毫米，其分离部分长3毫米；
蕊柱翅在蕊柱基部上方向前扩展为前端近锐尖的三角形；
蕊柱齿牙齿状；
药帽长圆锥形，前端收窄为狭长的尖头。
花期6月。
