小药八旦子,瘦弱多年生草本,高约15-20厘米。
块茎圆球形或长圆形,长8-20毫米,宽8-12毫米。
茎基以上具1-2鳞片,鳞片上部具叶,枝条多发自叶腋,少数发自鳞片腋内。
叶(1-)-2(-3)回三出,具细长的叶柄和小叶柄;
叶柄基部常具叶鞘;
小叶圆形至椭圆形,有时浅裂,下部苍白色,长9-25毫米,宽7-15毫米。
总状花序具3-8花,疏离。
苞片卵圆形或倒卵形,下部的较大,约长6毫米,宽3毫米。
花梗明显长于苞片,下部的长15-25(-40)毫米。
萼片小,早落。
花蓝色或紫蓝色。
上花瓣长约2厘米,瓣片较宽展,顶端微凹;
距圆筒形,弧形上弯,长(1-)1.2-1.4厘米;
蜜腺体约贯穿距长的3/4,顶端钝。
下花瓣长约1厘米,瓣片宽展,微凹,基部具宽大的浅囊。
内花瓣长7-8毫米。
柱头四方形,上端具4乳突,下部具2尾状的乳突。
蒴果卵圆形至椭圆形,长8-15毫米,具4-9种子。
种子光滑,直径约2毫米,具狭长的种阜。