秦岭耧斗菜，茎高40-60厘米，疏被白色短柔毛。
基生叶为二回三出复叶；
中央小叶菱状倒卵形，长1.2-3厘米，宽1.1-2.4厘米，顶端钝或有小尖头，基部楔形，三裂，中央裂片有3个圆齿，侧生小叶无柄，斜倒卵形，比中央小叶稍小，常二裂，无毛或基部有疏柔毛；
叶柄长4-10厘米。
花序有2-5花；
苞片三裂；
花梗长6-10厘米，上部有2钻形小苞片；
花直径约2.2厘米；
萼片紫色，椭圆形或卵形，长1.4-1.8厘米，顶端急尖，无毛；
花瓣紫色，无毛，瓣片长方形，长7-8毫米，距长1.2-1.5厘米，末端向内螺旋状弯曲；
雄蕊长5-9毫米，花药长圆形，长约1毫米；
退化雄蕊披针形，长约5毫米，有柔毛和腺毛；
花柱长5-6毫米。
蓇葖长1.4-1.5厘米，变无毛。
5-6月开花。
